【香港輕新聞】劍橋大學研究人員近日發表一篇追溯新冠病毒源頭的研究報告，指全球新冠病毒變異分化成3類，而與蝙蝠身上的冠狀病毒基因很相似的A型病毒雖在武漢出現，但卻在較多美國及澳洲樣本上找到。不過，有學者質疑研究很多地方出錯，無法支持其結論。

病毒有三種毒株版本

英國劍橋大學遺傳學家福斯特（Peter Forster）及研究團隊近日在學術期刊《美國國家科學院院刊》（PNAS）發表報告，在去年12月24日至今年3月4日間收集來自世界各地共160名確診者的病毒基因組，經過排序後發現病毒出現3類變異（variant），並以A、B及C分類。

A型更多出現在美澳病例

研究指，A型病毒與蝙蝠身上發現的病毒非常接近，並在疫情最初爆發的武漢找到，

亦被外界認為是在人類身上傳播的「原始」類型。但A型病毒並非武漢最流行的類型，反而較多出現於美國和澳大利亞的病例中，而同類病毒也在武漢居住過的美國人中發現。

B型病毒在東亞各國的患者中較普遍

此外，B型病毒則是由A型病毒經過兩度異變後產生，包括武漢在內的東亞地區樣本大多屬於B型，而在東亞地區外則極為少見。

C型於歐洲流行 亦在香港樣本找到

至於C型則是B型病毒的異變種，在法國、意大利、瑞典及英國的早期病例樣本上都有找到，屬歐洲的主要類型。該研究的中國內地的樣本中沒發現C型病毒，但在新加坡、香港及韓國的樣本中找到。

https://www.youtube.com/watch?v=fB8M37gx5xM

無法判定病毒起源

相關研究隨即引起外界關注，內地官媒《環球時報》採訪論文的第一作者、英國劍橋大學遺傳學家的福斯特（Peter Forster）， 對於病毒來源地的爭議，他形容是「燙手山芋」，並指目前仍無法就病毒來源地給出明確答案，但他們研究中發現的證據顯示，新冠病毒可能來自東亞，最初感染人類的時間則約在2019年9月13日至2019年12月7日這個區間。

A型沒在武漢大流行或與奠基者效應有關

究竟為何A型病毒未有在武漢和中國大流行，福斯特認為可能是「A型無法適應當地人的免疫系統」，所以才變異成B型，但也可能是當地更多的病例是由B型病毒感染者傳染出去，即遺傳學上的「奠基者效應」（founder effect），一群規模小而孤立的病毒，異變形成新群體。至於A型病毒更常見於在美國和澳洲的原因，他認為A型或適應該地方的人的免疫系統。

英國學者質疑病毒進化樹的根出錯

不過，英國愛丁堡大學生物科學學院教授安蘭巴特（Andrew Rambaut）近日在twitter上發表多篇帖文，批評論文錯漏百出，而當中最大問題是將新冠病毒進化樹的根（root）放置在蝙蝠冠狀病毒RaTG13。雖然RaTG13是最接近新冠狀病毒的非人類病毒，但它與新冠狀病毒的核苷酸差異（nucleotide differences）仍超過1100個位，因此研究從「根」就上就是錯誤，其結論無法支持。

研究樣本選擇不合適

蘭巴特強調，為應對新冠病毒疫情病情，全世界很多人努力研究病毒序列數據，也有團隊以先進方法解讀數據，而讓他感到受到難過的事，今次劍橋論文的作者從全球共享流感數據倡議組織（GISAID）中提取了一些數據，用易於使用的替代分析做了非常不合適的樣本選擇，並發布他們得到的結果。

The first is that tries to root a SARS-CoV-2 tree using the bat virus RaTG13. This is the closest non-human virus but still has > 1100 nucleotide differences to SC2. Note however the branch to the bat is a bit shorter than that for some reason.

— Andrew Rambaut ?????‍♂️ (@arambaut) April 9, 2020

What really bothers me is that these authors pull down some data from #GISAID run it through an easy to use software package, make some very inappropriate choices for this virus and publish what they get out.

— Andrew Rambaut ?????‍♂️ (@arambaut) April 9, 2020